O Programa de Pós-Graduação em Biodiversidade Vegetal (PPGBVeg) foi recomendado pela Coordenação de Aperfeiçoamento de Pessoal de Ensino Superior (CAPES) em 2009, em nível de Mestrado Acadêmico e com caráter interdepartamental, sendo pioneiro no processo de interiorização da pós-graduação stricto sensu da Universidade do Estado da Bahia (UNEB), que em consórcio com três departamentos da instituição onde há oferta de graduação em Ciências Biológicas: Departamento de Ciências Exatas e da Terra – DCET II (Alagoinhas), Departamento de Educação – DEDC VII (Senhor do Bonfim) e Departamento de Educação – DEDC VIII (Paulo Afonso), iniciou suas atividades em 2010.

O PPGBVeg tem como principal objetivo formar e aperfeiçoar pessoal para atuar na pesquisa científica, na docência e no desenvolvimento de atividades inerentes à área de Ciências Biológicas, especialmente da Botânica, produzindo conhecimento sistemático sobre a flora e os recursos vegetais da Região Nordeste através de inventários florísticos, estudos taxonômicos, filogenéticos, genéticos, micromorfológicos e ecológicos nas principais formações vegetacionais ocorrentes na região, visando contribuir para a preservação dos seus ecossistemas.